La Miata 1999 était offerte en six couleurs soit blanc, noir brillant, rouge classique, bleu crépuscule, reflet argent et vert grâce. Parmi les options, on retrouvait le toit rigide, la boîte automatique et l'ensemble sport aérodynamique comprenant les jupes latérales, le becquet arrière un déflecteur d'air avant. On retrouvait aussi le groupe cuir comprenant les freins ABS, les jantes de 15 pouces, le différentiel à glissement limité Torsen, le volant gainé de cuir, le système audio Bose avec lecteur CD et cassette, les glaces, le verrouillage et les rétroviseurs à commande électrique, le régulateur de vitesse et un écran pare-vent repliable. Le prix du modèle de base était de 26 025$ et pouvait être porté à plus de 30 000$ lorsque toutes les options étaient sélectionnées.

1999 soulignait aussi le 10e anniversaire de la Mazda Miata. Voilà une autre raison pour créer une édition spéciale. Cette version (10e anniversaire) était uniquement disponible en bleu saphir avec une capote de toit de même ton. L'habitacle regorgeait de cuir noir et de suède bleu, aussi bien sur les sièges que dans les portières et sur le volant. La planche de bord était caractérisée par des appliques de carbone et chrome du plus bel effet. De plus, cette version était équipée de jantes de 15 pouces polies, d'une boîte manuelle à 6 rapports et d'une plaque commémorative avec numéro d'identification. Seulement 150 unités furent vendues au Canada, dont 42 au Québec.

2000 - La Miata ne connut que très peu de changements en 2000. On ajouta au catalogue une nouvelle couleur, orange doré mica, non disponible avec le groupe cuir. De plus, les glaces, les rétroviseurs et le verrouillage à commande électrique étaient maintenant offerts en équipements de série sur tous les modèles. Le prix de la Miata 2000 augmenta cependant de 975$ par rapport à 1999.

Encore une fois, le nouveau millénaire était une occasion en or pour une édition spéciale. L'édition Millenium vit le jour. Seulement 250 exemplaires furent offert sur le marché canadien. À 34 790$, elle possédait toutes les caractéristiques du groupe cuir, l'ensemble sport aérodynamique, la boîte manuelle à 6 rapports, les jantes en aluminium poli de 15 pouces, le volant et le pommeau de levier de vitesses en bois Nardi, les appliques de bois sur la console centrale et plus encore.